為加快實施創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展戰(zhàn)略，國務(wù)院已出臺了促進科技成果轉(zhuǎn)化法及若干規(guī)定，明確可提取不低于50%的科技成果轉(zhuǎn)化收入用于獎勵科技成果的實際完成人，各地方政府亦據(jù)此制定了相應(yīng)的鼓勵政策。但在實際執(zhí)行過程中，由于對橫向課題（包括成果轉(zhuǎn)讓和技術(shù)服務(wù)）經(jīng)費的使用沒有單獨的規(guī)定，目前基本采用跟縱向課題（國撥資金）一樣的管理辦法，對經(jīng)費使用管得很緊，基本不能用于項目研究相關(guān)以外的開支，因此即使已經(jīng)有了科技成果收益分配比例的相關(guān)規(guī)定，但由于沒有明確的橫向課題經(jīng)費使用細則，審計部門對經(jīng)費使用查得又比較嚴，加上又出現(xiàn)過科技人員創(chuàng)業(yè)被查的事件，使得科技人員心有余悸，不敢支配和使用這些經(jīng)費，造成科技人員事實上尚無法真正享受到科技成果轉(zhuǎn)化收益，傷害了科技人員的成果轉(zhuǎn)化積極性，阻礙了科技成果產(chǎn)業(yè)化的進程。

為此，建議國家對縱向課題和橫向課題分開管理，不能用縱向課題經(jīng)費使用辦法管理橫向課題經(jīng)費，應(yīng)該出臺區(qū)別于縱向國撥經(jīng)費的更加靈活的橫向科研經(jīng)費使用管理辦法和細則。橫向課題的經(jīng)費使用國家只做指導(dǎo)，由單位自行決定，讓科技成果的實際完成人能夠名正言順的獲取科技創(chuàng)新的收益，真正鼓勵科研人員大膽創(chuàng)新、成果轉(zhuǎn)化，推動科技與經(jīng)濟的緊密結(jié)合，促進國家和地方的科技創(chuàng)新和經(jīng)濟發(fā)展。